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Relatório de boas vibrações sobre a ligação de quadruplex de DNA de uma sonda de IR de polipiridil de rutênio amplificada por estado excitado

Título	Relatório de boas vibrações sobre a ligação de quadruplex de DNA de uma sonda de IR de polipiridil de rutênio amplificada por estado excitado
Autores	Mark Stitch, Davide Avagliano, Daniel Graczyk, Ian P. Clark, Leticia González, Michael Towrie, Susan J Quinn
Revista	Jornal da Sociedade Americana de Química
data	09/22/2023
Doi	https://doi.org/10.1021/jacs.3c06099
Introdução	O estudo demonstra como o complexo Ru(II)polipiridil com nitrila atua como uma sonda infravermelha sensível para estruturas G-quadruplex. A espectroscopia de absorção UV-visível mostra a ligação específica do enantiômero para o híbrido htel(K) e o antiparalelo htel(Na) G4s formado pela sequência do telômero humano. A espectroscopia de infravermelho resolvida no tempo (TRIR) do complexo com excitação de 400 nm revela interações dominantes com bases de guanina para ligações de Λ-1/htel(K), Δ-1/htel(K) e Λ-1/htel(Na). Por outro lado, a ligação Δ-1/htel(Na) interage com as bases de timina e adenina no loop. O transiente de nitrila a 2232 cm-1 muda linearmente para uma frequência mais baixa à medida que o ambiente de ligação de hidrogênio diminui em misturas de DMSO/água, servindo como um repórter do ambiente de nitrila dentro da bolsa de ligação. A vida útil do complexo em D2O aumenta com a ligação do DNA, indicando maior proteção do ambiente do solvente, corroborada por simulações de dinâmica molecular e cálculos de energia de ligação. Isso ressalta a utilidade das sondas de infravermelho na determinação dos locais de ligação de agentes fotoativos e seu potencial em relatar ambientes biológicos.
Citação	Mark Stitch, Davide Avagliano e Daniel Graczyk et al. Good Vibrations Report on the DNA Quadruplex Binding of an Excited State Amplified Ruthenium Polypyridyl IR Probe. J. Am. Chem. Soc. 2023. Vol. 145(39):21344-21360. DOI: 10.1021/jacs.3c06099
Elemento	Potássio (K) , Rutênio (Ru) , Sódio (Na)
Materiais	Compostos químicos
Temas	Materiais fotônicos e optoeletrônicos , Materiais biomédicos

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