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    • O atlas genômico nacional da Listeria que vive no solo revela os efeitos da seleção e da ecologia populacional na evolução do pangenoma

    Título O atlas genômico nacional da Listeria que vive no solo revela os efeitos da seleção e da ecologia populacional na evolução do pangenoma
    Autores Jingqiu Liao, Xiaodong Guo, Daniel L. Weller, Shaul Pollak, Daniel H. Buckley, Martin Wiedmann, Otto X. Cordero
    Revista Microbiologia da Natureza
    data 07/15/2021
    Doi 10.1038/s41564-021-00935-7
    Introdução As populações bacterianas em ambientes naturais apresentam uma extensa diversidade genômica, em grande parte devido a mudanças no conteúdo gênico decorrentes da troca de DNA com o ambiente. Os fatores ecológicos precisos que impulsionam essa variação genômica e a influência da seleção são assuntos de debate contínuo. Este estudo aborda essas questões compilando um atlas nacional abrangente de 1.854 cepas de Listeria, sistematicamente isoladas de solos em todo o território dos Estados Unidos. Observou-se que a Listeria ocupou diversas condições ambientais, influenciadas principalmente pela umidade do solo, molibdênio e níveis de salinidade. A análise dos dados de todo o genoma de 594 cepas representativas permitiu a classificação da diversidade de Listeria em 12 filogrupos, cada um mostrando faixas de habitat e graus de endemismo distintos. Os filogrupos com ampla presença ambiental, denominados "cosmopolitas", possuíam pangenomas mais expansivos e apresentavam desequilíbrio de ligação reduzido, indicativo de taxas elevadas de aquisição, perda e transferência de alelos de genes em comparação com filogrupos adaptados a habitats mais restritos. Esses filogrupos cosmopolitas também continham uma proporção significativa de genes afetados pela seleção positiva. O impacto da seleção positiva foi particularmente evidente no genoma central específico do filogrupo, sugerindo que esses genes centrais são cruciais para a adaptação em linhagens específicas. Essas descobertas demonstram que a adaptabilidade genômica e a recombinação são resultados de pressões seletivas para a persistência em ambientes variados.
    Citação Jingqiu Liao, Xiaodong Guo e Daniel L. Weller et al. Nationwide genomic atlas of soil-dwelling Listeria reveals effects of selection and population ecology on pangenome evolution. Nat. Microbiol. 2021. DOI: 10.1038/s41564-021-00935-7
    Elemento Molibdênio (Mo) , Sódio (Na)
    Indústria Agricultura , Pesquisa e laboratório
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